使用ft-icr-ms/ms的对于牙龈炎和牙周炎的生物标志物的唾液蛋白质组分析的制作方法
[0063] 而根据所述方法的再另一个方面,一种用于诊断牙周炎疾病的状态的方法包括提 供至少一个銀沟液(GC巧和唾液样品,选择一组蛋白质生物标志物用于鉴定牙周炎的特定 状态,和测定选择的蛋白质生物标志物组中的表达水平来诊断口腔疾病的状态。
[0064] 在所述方法的一些方面,通过分析銀沟液佑C巧和唾液的蛋白质组选择该生物标 志物组。蛋白质组学分析可包括鉴别为变化的牙周炎状态中过表达或低表达的蛋白质的傅 立叶变换-串联质谱法(FT MS/M巧分析。
[0065] 该方法的另一个方面,生物标志物可W包括可用于诊断疾病状态的仅一个特定的 生物标志物或特定生物标志物的组合。测定一个、两个或更多个蛋白质生物标志物的表达 水平W确定口腔疾病的状态。在进一步的方面中,测定H个、四个、五个或更多个生物标志 物并且用来确定口腔疾病的状态。
[0066] 在该方法的各个方面,所述一种或多种蛋白质生物标志物选自于血红蛋白a和 目链、碳酸酢酶1(国际蛋白质索引或"IPI"#IPI〇〇980674)和丝束蛋白-1。可W使用根据 此方面的方法来区分健康状态、牙銀炎状态、牙周炎的轻度状态和重度状态。
[0067] 而在所述方法的另一个方面,所述一种或多种蛋白质生物标志物选自于S100-P、 转酵醇酶、S100-A8(巧粒蛋白-A)、肌球蛋白-9、血红蛋白a和血红蛋白目。可W使用根 据此方面的方法来确定牙周炎的重度状态,并区分牙周炎的严重状态与较轻状态,如轻度 牙周炎和牙銀炎。
[0068] 在所公开的方法的一些方面,一种或多种蛋白质生物标志物选自于a-1酸性 糖蛋白1和2、基质金属蛋白酶-9、肤醜脯氨醜顺-反异构酶A和结合珠蛋白相关蛋白 (IPI00431645. 1)。可W使用根据此方面的方法来确定牙周炎的重度状态,并区分牙周炎的 重度状态与较轻状态,如轻度牙周炎和牙銀炎。
[0069] 在所述方法的再另一个方面,选择蛋白质生物标志物a -N-己醜氨基半乳糖巧酶 用于鉴别牙銀炎或轻度牙周炎状态,并区分它们与重度牙周炎状态。
[0070] 在所述方法的进一步的方面,一种或多种蛋白质生物标志物选自于NADPH氧化酶 W及a -N-己醜氨基半乳糖巧酶用于鉴别牙銀炎或轻度牙周炎,并区分它们与重度牙周炎 状态。
[0071] 根据一些方面,用于诊断口腔疾病状态的方法还包括提供GCF和唾液样品,通过 分析GCF样品和唾液样品的蛋白质组产生第一和第二蛋白质谱,和确定第一和第二蛋白质 谱之间的重叠区域。选择用于区分牙周炎特定状态的蛋白质生物标志物组可W包括计算在 牙周炎的不同阶段中重叠区域内蛋白质丰度的变化,和选择在单一牙周炎状态中低表达或 过表达的那些蛋白质。
[0072] 而在另一个方面,前面的实施方式所公开的用于诊断口腔疾病状态的方法由诊断 试剂盒实施。该诊断试剂盒包含用于鉴别口腔疾病状态的一组蛋白质生物标志物。该试剂 盒包括进行所公开方法的分析的必要试剂。
[0073] 虽然已经根据各种实施方式和实施例对本申请进行了描述,可W理解的是本领域 的技术人员能够想到变型或改进。因此,只有出现在权利要求中的该样的限制应当置于所 公开的实施方式中。 实施例
[0074] 实施例1
[00巧]分析銀沟液佑C巧和唾液的蛋白质组W确定用于不同口腔疾病状态(如牙銀炎、 轻度牙周炎和重度牙周炎)的生物标志物。从几个病人的口中无创地采集GCF和唾液样品。 将与傅立叶变换-串联质谱法(FTMS/M巧结合的液相色谱技术用于从样品内分离蛋白质生 物标志物并鉴别蛋白质生物标志物。
[0076] 可W向从牙周健康志愿者、患有牙銀炎的那些、具有轻度和重度牙周炎的那些,W 及没有牙齿者(无齿对照)的那些收集的样品应用FTMS/MS蛋白质组学方法W尝试和阐明 区分健康和疾病口腔状态的生物标志物组合。特别地,通过銀沟液佑C巧和刺激的唾液的 非推定蛋白质组学分析,进行FT MS/MS方法来发现新的蛋白质生物标志,其能够:
[0077] 1.区分牙周健康和疾病;
[007引 2.区分牙銀炎和牙周炎;
[0079] 3.区分轻度和重度牙周炎。
[0080] 研究设计 [0081 ] 表 1
[0082]
【主权项】
1. 一种用于诊断牙周炎疾病的状态的方法,其包括: 提供龈沟液(GCF)样品和唾液样品的至少一种; 选择一组蛋白质生物标志物用于鉴别牙周炎的特定状态;和 测定选择的蛋白质生物标志物组中的表达水平来诊断牙周炎疾病的状态。
2. 根据权利要求1的方法,其中该蛋白质生物标志物组被选择用于区分牙龈炎状态和 牙周炎状态。
3. 根据权利要求1的方法,其中该蛋白质生物标志物组被选择用于区分牙周健康和疾 病状态。
4. 根据权利要求1的方法,其中该蛋白质生物标志物组被选择用于区分轻度牙周炎状 态和重度牙周炎状态。
5. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于血红蛋 白a和0链、碳酸酐酶1(国际蛋白质索引或"IPI"#IPI〇〇980674)和丝束蛋白-1的至少 一种蛋白质。
6. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于 S100-P、转醛醇酶、S100_A8(钙粒蛋白-A)、肌球蛋白-9、血红蛋白a和血红蛋白0的至 少一种蛋白质。
7. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于a -1酸 性糖蛋白1和2、基质金属蛋白酶-9、肽酰-脯氨酰顺-反异构酶A和结合珠蛋白相关蛋白 (IPI00431645. 1)的至少一种蛋白质。
8. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于NADPH 氧化酶和a-N乙酰氨基半乳糖苷酶的至少一种蛋白质。
9. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括a -N乙酰氨基 半乳糖苷酶。
10. 根据权利要求1-4中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于蛋白 质 S100-A11 (IPI00013895. 1)、蛋白质 IPI00037070. 3、过氧化氢酶(IPI00465436. 4)、胆碱 转运蛋白样蛋白2衍生物(IPI00903245. 1)和肌联蛋白异形体N2-B(IPI00985334. 2)的至 少一种蛋白质。
11. 根据权利要求5-8和10中任一项的方法,其中该蛋白质生物标志物组包括两种或 更多种生物标志物。
12. -种用于诊断牙周炎疾病的状态的试剂盒,包含一组被选择用于区分牙龈炎和牙 周炎的蛋白质生物标志物。
13. 根据权利要求12的试剂盒,其中该蛋白质生物标志物组包括选自于血红蛋白a和 3链、碳酸酐酶1(国际蛋白质索引或"IPI"#IPI〇〇980674)和丝束蛋白-1的至少一种蛋 白质。
14. 根据权利要求12的试剂盒,其中该试剂盒诊断牙龈炎或轻度牙周炎,和该蛋白质 生物标志物组进一步包括至少一种来自唾液数据群1B、1D、1A4和1A5的蛋白质生物标志 物。
15. 根据权利要求1-11中任一项的方法,还包括: 提供GCF样品和唾液样品两者; 通过分析GCF样品和唾液样品的蛋白质组产生第一和第二蛋白质谱; 确定第一和第二蛋白质谱之间的重叠区域; 其中,选择用于区分牙周炎的特定状态的蛋白质生物标志物组包括计算在牙周炎的不 同阶段中重叠区域内的蛋白质丰度的变化,和选择那些在牙周炎的单一状态中低表达或者 过表达的蛋白质。
16.根据权利要求1-11中任一项的方法,还包括: 通过分析至少一种口液样品的蛋白质组产生蛋白质谱;和 聚类该蛋白质谱来确定一组蛋白质生物标志物。
【专利摘要】用于诊断牙周炎疾病状态的方法包括选择一组蛋白质生物标志物,包括已显示为在牙周炎的特定阶段中丰度发生改变的一种或多种生物标志物。该组蛋白质生物标志物可以在所获取的龈沟液(GCF)或者唾液口腔液样品中鉴定和定量表达,以区分牙周炎的不同状态。诊断不同严重程度的牙周炎口腔疾病的状态,如牙龈炎、轻度牙周炎或重度牙周炎,的方法可以包括选择能够区分牙周炎的不同阶段的一组蛋白质生物标志物。
【IPC分类】G01N33-68
【公开号】CN104620110
【申请号】CN201380047057
【发明人】I·查普尔, A·克里斯, M·格兰特
【申请人】皇家飞利浦有限公司
【公开日】2015年5月13日
【申请日】2013年9月10日
【公告号】CA2884089A1, EP2893353A2, US20150219665, WO2014037924A2, WO2014037924A3
文档序号 :
【 8303328 】
技术研发人员:I·查普尔,A·克里斯,M·格兰特
技术所有人:皇家飞利浦有限公司
备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
声 明 :此信息收集于网络,如果你是此专利的发明人不想本网站收录此信息请联系我们,我们会在第一时间删除
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